Добрый день, Светлана!
Ежедневно в своих молитвах Церковь молится: «о Богохранимой стране нашей, властях и воинстве её» (великая и сугубая ектении на каждой Литургии, утрене и вечерне), понимая, что далеко не все во власти и в армии являются православными христианами, и далеко не все там просили за них молиться. Также мы ежедневно молимся (без всякого на то согласия) за «ненавидящих и обидящих нас» (см. молитвы на сон грядущим) и т.д. Поэтому молиться за всех — это наш долг. Другое дело, что молитва наша не должна быть автоматической: просто произнести обычные слова молитвы за живых и усопших, а потом бездумно и без разбора перечислять все подряд имена. Конечно, молитва за наших братьев и сестер по вере (как живых, так и усопших) должна по содержанию отличаться от молитвы за иноверцев, за неверующих и т.д. Для них мы должны просить вразумления, просвещения их светом Христовой истины, а для умерших вне Церкви — милости Божией и утешения, насколько оно возможно для их душ, пребывающих в отчуждении от Бога (с Которым при жизни они не сроднились через Христа, через Крещение и Причащение Его Тела и Крови, через исполнение Его заповедей и общение с Ним в молитвах).
О поминовении неверующих за Литургией можно прочесть на странице нашего сайта.